Со дня организации кафедры на ее базе проводится обучение студентов 4 и 5 курсов по предмету факультетская хирургия и госпитальная хирургия соответственно. В период с 1979 по 1991 год на кафедре студенты 6 курса лечебного факультета проходили субординатуру по хирургии. Кафедра факультетской и госпитальной хирургии была одной из основных учебных баз республики по подготовке хирургов по программе первичной интернатуры и клинической ординатуры по специальности «Хирургия». Ответственными по учебной работе на кафедре были доценты Кабильжанов О.Ф., Расулева М.В., Кадыров Р.Ю., Исмаилова Д.А. За годы работы в институте, за большой вклад в обучение студентов доценты Исмаилова Д.А. и Имамов А.А. были удостоены звания «Лучший педагог института».

Сотрудники кафедры и обучающиеся студенты активно работали в студенческом научном обществе. В разные годы ответственными за СНО на кафедре были доценты: Зимин Г.А., Исмаилова Д.А., Имамов А.А. Благодаря их усердной работе наиболее одаренные студенты, подготовленные на кафедре, неоднократно становились победителями республиканских Олимпиад среди медицинских институтов, а их научные работы оценивались, как правило, на «отлично». В дальнейшем многие победители республиканских олимпиад продолжали обучение на нашей кафедре в качестве клинических ординаторов и резидентов. А наиболее одаренные из них защитили диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. В настоящее время многие работающие на кафедре доценты и ассистенты были в прошлом активными членами СНО.

В настоящее время на кафедре факультетской и госпитальной хирургии продолжают обучаться студенты 4 и 5 курсов лечебного факультета. На кафедре непрерывно продолжает совершенствоваться учебный процесс. Внедрение в учебный процесс основных вопросов, отраженных в программе «Реформирования высшего образования», создание учебно-методической литературы по программе факультетской и госпитальной хирургии. При обучении студентов используются современные педагогические технологии, которые оказывают большой вклад в подготовку высококвалифицированных врачей общей практики. Неоценимый вклад в улучшение педагогической работы оказало создание на кафедре пяти тематических учебных кабинетов.

Эти тематические кабинеты охватывают всю учебную программу по факультетской и госпитальной хирургии. В них имеются специальные баннеры, посвященные частным вопросам хирургии, учебная и научная литература, компьютеры, подключенные к интернету, набор инструментов для проведения и освоения практических навыков. Создание тематических учебных кабинетов оказало огромное влияние на качество преподавания и максимально приблизило учебный процесс к практической деятельности врача общей практики.